La SG-1 rentre de mission boulversée, sans Daniel. Ils déclarent que ce dernier est mort.
Cependant Daniel est en réalité dans une pièce avec une créature qui le garde prisonnier car elle pense qu'il sait où se trouve sa femme grâce à ses conaissances archéologiques. Mais sur Terre, le doûte nait dans les têtes des membres de la SG-1. Pendant que Daniel tente d'aider la créature, la SG-1 retourne sur la planète pour le retrouver...
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13. Hathor Hathor
Une femme entre dans la base et dit être Hathor, la déesse Egyptienne de la musique. Mais petit à petit elle hypnose tous les hommes de la base. Sam et quelques autres femmes vont tenter de délivrer la base du sortilège...
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14. Cassandra Singularity
La SG-1 découvre, sur une planète où ils devaient observer un trou noir, toute la population décimée par une bactérie. Mais une petite fille, Cassandra, a survécu. La SG-1 la ramène sur Terre. Mais ils découvrent plus tard qu'elle a une bombe puissante dans son corps. Ils veulent la renvoyer sur sa planète mais si elle s'approche trop de la porte, la bombe explosera...
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15. Le procès Cor'aï
Dans un village sur une planète, un homme accuse Teal'c d'avoir tué son père. Jack va tout faire pour le sortir de ce pétrin avec l'aide de ses amis tandis que Teal'c s'obstine d'accepter la punition qui lui sera donnée...
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16. Les réfugiés Enigma
La SG-1 sauve les Tollans en les ramenant sur Terre avant une éruption volcanique. Hammond essaye de leur trouver une terre d'accueil mais le Président et Mayborn veulent les garder pour s'emparer de leur technologie très développée...
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17. Portés disparus Solitudes
Samantha et Jack se retrouve seuls dans une sorte de crevasse au fond d'un glacier. Jack a une jambe cassée ainsi qu'une côte mais ils ne peuvent pas retourner sur Terre car le tableau de commandes ne marche pas. Sur Terre, Daniel cherche un moyen de les retrouver...
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18. Les doubles robotiques Tin man
L'équipe de Jack O'Neill se retrouve dans une base souterraine étrange où habite, seul, Arlan. Ce personnage tente de les convaincre de rester sur la planète mais la SG-1 retourne tout de même sur Terre. Ils découvrent qu'ils sont dans un corps de robot synthétique...
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19. Une dimension trop réelle There but for the grace of god
Après avoir touché un objet inconnu, Daniel Jackson, se retrouve dans une dimension parallèle identique à la Terre qui est attaquée par les Goa'ulds....
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20. Décision politique Politics
Le Sénateur Kinsey se rend à la base pour enquêter sur les sommes d'argents déboursées pour la porte des étoiles et décider si le projet Stargate sera arrêté. Hammond et la SG-1 prennet la défense du projet. Mais Daniel, qui est revenu de la dimension parralèle, affirme que la Terre va être attaquée par les Goa'ulds et que si le projet s'arrête, la Terre succombera...
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21. Dans le nid du serpent Within the serpent's grasp
Le projet Stargate est arrêté, mais Daniel réussi à convaincre le reste de l'équipe à utiliser une dernière fois la porte pour infilter le vaisseau Goa'uld et sauver ainsi la Terre...
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